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酶怎樣把氨基酸鏈打成“套索結(jié)”

新華社北京9月27日電 美國研究人員借助人工智能工具,發(fā)現(xiàn)了一種酶怎樣把氨基酸鏈打成特殊的“套索結(jié)”,形成套索肽分子。該成果有助于設(shè)計以套索肽為基礎(chǔ)的藥物。

套索肽是一類在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的多肽分子,通常由15至26個氨基酸組成,氨基酸鏈經(jīng)過折疊形成類似套索的結(jié)構(gòu)。套索肽性質(zhì)非常穩(wěn)定,并具有抗菌、抗病毒、抗腫瘤等作用,是生物制藥的研究熱點之一。但其獨特的套索結(jié)構(gòu)難以用化學(xué)手段合成,限制了相關(guān)研究的發(fā)展。

套索環(huán)化酶在氨基酸鏈形成“套索結(jié)”的過程中起到重要作用。美國伊利諾伊大學(xué)厄巴納-尚佩恩分校研究團隊說,他們詳細(xì)研究了其中一種名為FusC的酶,結(jié)合生物信息學(xué)、分子動力學(xué)等多種手段建立模型,展現(xiàn)了待折疊的氨基酸鏈與FusC分子相互作用的三維結(jié)構(gòu)。相關(guān)論文發(fā)表在英國《自然·化學(xué)生物學(xué)》雜志上。

FusC酶分子由約600個氨基酸組成,在折疊過程中起作用的活性位點包含120個氨基酸。研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)usC分子中一個稱為“11號螺旋”的部位對套索結(jié)的形成特別重要,它位于活性位點的后壁區(qū)域。在此基礎(chǔ)上,研究團隊設(shè)計出“11號螺旋”部位發(fā)生變異的FusC酶,成功地把天然環(huán)化酶無能為力的一些氨基酸鏈打成“套索結(jié)”。

研究人員說,該發(fā)現(xiàn)可能適用于其他的環(huán)化酶,有助設(shè)計制造多種套索肽。他們已在實驗中高效生產(chǎn)出能與一個重要抗癌靶點“整合素αvβ8”緊密結(jié)合的套索肽,驗證了該成果的實用性。

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